В какой суд обжаловать решение налогового органа?

После того, как Вы обжаловали не устраивающее Вас решение налогового органа в вышестоящий налоговый орган и получили отрицательный ответ, иной перспективы оспорить решение налогового органа, кроме судебной, просто нет.

В какой же суд обращаться ?

Если решение вынесено в отношении юридического лица – обращаться нужно в арбитражный суд по месту нахождения налогового органа (в каждом субъекте Федерации – один арбитражный суд, «промахнуться» с территориальной подсудностью невозможно).
Если решение принято в отношении физического лица, не имеющего статуса индивидуального предпринимателя, обращаться нужно в суд общей юрисдикции по месту нахождения налогового органа, принявшего решение, или по своему месту жительства.

Если решение вынесено в отношении индивидуального предпринимателя, есть два варианта:

1. в случае, если на момент судебного обжалования индивидуальный предприниматель не утратил своего статуса, заявление о признании недействительным акта налогового органа подается в арбитражный суд по месту нахождения налогового органа;

2. в случае, если на момент обращения в суд с заявлением об оспаривании решения налогового органа индивидуальный предприниматель утратил свой статус (по какой-либо причине государственная регистрация гражданина в качестве ИП прекращена), обращаться следует в суд общей юрисдикции, не смотря на то, что речь идет об оспаривании решения, принятого в связи с осуществлением лицом предпринимательской деятельности.

Разъяснения по поводу подведомственности дел с участием ИП и бывших ИП арбитражным судам и судам общей юрисдикции содержатся в п. 13 Постановления Пленума ВАС РФ № 8 и Пленума Верховного Суда РФ № 6 «О некоторых вопросах, связанных с применением части первой Гражданского кодекса Российской Федерации».